南京二本大学有：南京财经大学、南京审计大学、南京林业大学、南京医科大学、南京信息工程大学、南京工业大学、南京工程学院、南京中医药大学。
南京二本学院有：江苏警官学院、南京艺术学院、江苏第二师范学院、南京晓庄学院、南京大学金陵学院、东南大学成贤学院、南京特殊教育师范学院、南京航空航天大学金城学院、南京体育学院、南京工业大学浦江学院、南京师范大学泰州学院、南京医科大学康达学院、南京理工大学紫金学院、南京邮电大学通达学院、南京理工大学泰州科技学院。参考资料大学生必备网：http://www.dxsbb.comews/1502.html
二本院校可多了，例如晓庄学院，三江学院，江苏海事学院……等等。