根据2025年QS世界大学排名，以下是日本较好的大学排名：
东京大学 - 世界排名第32
京都大学 - 世界排名第50
东京工业大学 - 世界排名第84
大阪大学 - 世界排名第86
东北大学 - 世界排名第107
名古屋大学 - 世界排名第152
九州大学 - 世界排名第167
北海道大学 - 世界排名第173
早稻田大学 - 世界排名第181
庆应义塾大学 - 世界排名第188
此外，泰晤士高等教育（THE）2025年世界大学排名中，日本大学的表现也较为突出，东京大学位列第28位，京都大学位列第55位，东北大学位列第120位，大阪大学位列第162位，东京工业大学位列第195位。
这些大学在学术声誉、研究能力、国际化程度等方面表现优异，是日本乃至全球范围内的高等教育顶尖学府。