根据最新的排名信息，常熟市最好的大学是常熟理工学院。以下是常熟理工学院在不同排名系统中的最新情况：
软科排名：2024年常熟理工学院在全国排名第280位。
校友会排名：2025年常熟理工学院在全国排名第342位。
ABC中国大学排名：2025年常熟理工学院在全国排名第406位。
常熟理工学院是常熟市唯一一所本科高等院校，也是江苏省的一所应用型本科高校，其理工科专业较为强势。其他常熟市的高等教育机构包括常熟职业教育中心、常熟广播电视大学和常熟社区大学，但这些机构主要以职业教育和成人教育为主，排名信息较少。
如果您需要更详细的排名信息或其他高校的情况，可以参考相关排名机构的官方数据。