主要区别如下：
1、人才培养的目标不同：应用型大学一般是培养一些偏向应用知识的人才，需要有一定的开发研究能力；研究型大学一般是培养研究型人才，专注于某个领域中的深度研究。
2、研究问题不同：研究型大学是要解决学术问题，研究课题集中在基础研究，偏向于数学、物理、力学等比较基础的知识层面上；应用型大学会把精力投入一些工程问题上，研究如何来提高效率、开发新的结构或新的系统等。
学术研究型大学是以基础科学为主的学校，重在理论研究，学生毕业通常进行基础研究；应用型大学是以科技落地为主的大学，重在如何把理论应用于实际，学生毕业通常是动手能力强，能直接进入某一型号产品的研究