不是三本，
它是北京大学重点培养优秀学生的一个学院，每年从考入北京大学的其他学院中遴选一批优秀的学生进入元培学院学习。
元培学院，是以北京大学老校长蔡元培先生命名，任务是：继续贯彻“加强基础、淡化专业、因材施教、分流培养”的十六字方针，积极稳妥地推进北大本科教育教学改革，借鉴世界优秀大学的成功经验，建立适合中国和北大实际的本科人才培养模式和管理体制，更好地实现北大的人才培养目标。
2001年9月学校成立元培计划管理委员会，负责全面推进全校范围的本科教学改革；与此同时，设立了元培计划执行委员和实验班，开展人才培养模式的探索与实践；2007年北大第一个非专业类本科学院“元培学院”正式成立，标志着北大本科教育改革进入一个新的阶段。
不是，北大元培学院属于一本。该学院的学生都由北京大学当年其他学院新入学的优秀学生组成，是北京大学重点培养学生的集中体。通俗讲就是一所大学的重点学院。其管理方式也与其他学院不同。刚进入该学院的学生起初不区分专业，后来每位学生会有专门的导师负责。
不是。北大元培学院不仅录取分数线跟北大正常一样，而且进入元培学院的学生，需要成绩更好。元培学院学生入学时不分专业第二年可以任意选择北大的专业，因此进入元培学院意味着得有更高的分数。