正厅级。
学校是国家高等教育综合改革试验校，是由广东省领导和管理的全日制公办普通高等学校，是深圳市创办的一所创新型大学。
2011年3月，南科大教改实验班开学，2012年4月，教育部同意建立南方科技大学，并赋予学校探索具有中国特色的现代大学制度、探索创新人才培养模式的目标。
2018年5月，南方科技大学获批博士学位授予单位，成为国内最快获得博士授权单位的高校。
南方科技大学是位于经济特区广东省深圳市的一所名牌大学。尽管南方科技大学成立得比较晚，很年轻，但是投入大产出也高，定位非常高，师资力量和生源的水平也很高，所以社会认可度很高。尽管不是985，211大学，但是南科大在第二轮双一流高校评选中顺利晋级，成为深圳第一所本土双一流高校。
应属正厅级。由于南方科技大学采用新型办学机制，校长采用聘任制，并不保证所有校长都有行改级别。