其一，中山大学的经费问题。中山大学每年的经费预算虽然很高，甚至偶尔能排到全国前五，但在校生非常多，这就导致了人均经费比其他学校要低，此外，中山大学的科研经费占比相对较低，这也会导致中山大学的科研成绩不理想，影响排名。
其二，中山大学偏科较严重。中山大学的工科一直都是弱势，中大文理医商等专业，好的能进前五，差的基本也都是前十，唯独工科基本都在十名二十名开外，对于一所综合类大学来说，偏科就会影响综合实力。
中山大学不能排名全国前列的原因是：
中山大学是一所比较好的大学，在广东省是比较有名的，但是在全国来说，与靠前的大学是有一点距离的，所以排名进不了前十。
因为在国内的高校排名评价机制中，中科大常常被低估，加上中科大本身不在乎排名的因素，不会为了排名而费尽心机，所以才导致常常被低估。